1、地方企業(yè)向省、自治區(qū)、直轄市、計劃單列市相關(guān)主管部門（以下簡稱“相關(guān)主管部門”）提出申請并按要求上報申請材料，申請材料包括：《國家認定企業(yè)技術(shù)中心申請報告》和《企業(yè)技術(shù)中心評價材料》。

2、相關(guān)主管部門會同同級科技、財政、海關(guān)、稅務等部門對企業(yè)上報的申請材料進行審查，按照國家有關(guān)要求，確定推薦企業(yè)名單。相關(guān)主管部門會同同級科技部門將推薦企業(yè)的申請材料在規(guī)定時間內(nèi)上報國家發(fā)展改革委，同時將推薦企業(yè)名單抄報科技部、抄送同級財政部門、主管海關(guān)、國家稅務局。

3、國務院有關(guān)部門、計劃單列企業(yè)集團、中央管理企業(yè)可按要求將推薦企業(yè)的申請材料直接上報國家發(fā)展改革委，同時將推薦企業(yè)名單抄送科技部、財政部、海關(guān)總署、國家稅務總局。

4、國家發(fā)展改革委委托中介評估機構(gòu)，按照《企業(yè)技術(shù)中心評價指標體系》對企業(yè)申請材料進行初評。

5、依據(jù)初評結(jié)果，國家發(fā)展改革委牽頭商科技部、財政部、海關(guān)總署、國家稅務總局等有關(guān)部門，組織專家擇優(yōu)進行綜合評審。

6、國家發(fā)展改革委會同科技部、財政部、海關(guān)總署、國家稅務總局依據(jù)國家產(chǎn)業(yè)政策、國家進口稅收稅式支出的總體原則及年度方案、初評結(jié)果、專家評審意見等進行綜合審查后，擇優(yōu)確定國家認定企業(yè)技術(shù)中心名單。